Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tpgs1Q99MS8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpgs1Q99MS8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpgs1Q99MS8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpgs1Q99MS8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpgs1Q99MS8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 386.5 ms