Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Atp1b4Q99ME6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Atp1b4Q99ME6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Atp1b4Q99ME6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Atp1b4Q99ME6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Atp1b4Q99ME6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Atp1b4Q99ME6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Atp1b4Q99ME6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms