Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cstf3Q99LI7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cstf3Q99LI7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cstf3Q99LI7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cstf3Q99LI7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 450.6 ms