Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE1

Rilpl2, RILP-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl2Q99LE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rilpl2Q99LE1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rilpl2Q99LE1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rilpl2Q99LE1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rilpl2Q99LE1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rilpl2Q99LE1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl2Q99LE1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rilpl2Q99LE1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rilpl2Q99LE1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rilpl2Q99LE1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rilpl2Q99LE1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms