Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prpf19Q99KP6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prpf19Q99KP6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf19Q99KP6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms