Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GatbQ99JT1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GatbQ99JT1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GatbQ99JT1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GatbQ99JT1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GatbQ99JT1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms