Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl22Q99JN2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl22Q99JN2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl22Q99JN2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl22Q99JN2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl22Q99JN2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms