Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ddb2Q99J79 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddb2Q99J79 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddb2Q99J79 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddb2Q99J79 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddb2Q99J79 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddb2Q99J79 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms