Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc8b1Q925Q3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc8b1Q925Q3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8b1Q925Q3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc8b1Q925Q3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc8b1Q925Q3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc8b1Q925Q3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc8b1Q925Q3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8b1Q925Q3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8b1Q925Q3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8b1Q925Q3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8b1Q925Q3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8b1Q925Q3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc8b1Q925Q3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc8b1Q925Q3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms