Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn16Q925N4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn16Q925N4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn16Q925N4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms