Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trps1Q925H1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trps1Q925H1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trps1Q925H1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trps1Q925H1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trps1Q925H1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
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