Protein–RNA interactions for Protein: Q924T7

Rnf31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf31Q924T7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf31Q924T7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf31Q924T7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf31Q924T7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf31Q924T7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf31Q924T7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf31Q924T7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf31Q924T7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf31Q924T7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms