Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrif1Q923B3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrif1Q923B3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nrif1Q923B3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nrif1Q923B3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nrif1Q923B3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms