Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Med28Q920D3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Med28Q920D3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med28Q920D3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms