Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prpf6Q91YR7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf6Q91YR7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prpf6Q91YR7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prpf6Q91YR7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prpf6Q91YR7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms