Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Trpm2Q91YD4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Trpm2Q91YD4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Trpm2Q91YD4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Trpm2Q91YD4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Trpm2Q91YD4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Trpm2Q91YD4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Trpm2Q91YD4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Trpm2Q91YD4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms