Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha8Q91Y12 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha8Q91Y12 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha8Q91Y12 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha8Q91Y12 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha8Q91Y12 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha8Q91Y12 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha8Q91Y12 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdha8Q91Y12 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdha8Q91Y12 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdha8Q91Y12 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdha8Q91Y12 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcdha8Q91Y12 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcdha8Q91Y12 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcdha8Q91Y12 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms