Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha9Q91Y11 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha9Q91Y11 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha9Q91Y11 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdha9Q91Y11 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha9Q91Y11 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha9Q91Y11 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha9Q91Y11 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha9Q91Y11 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdha9Q91Y11 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdha9Q91Y11 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdha9Q91Y11 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha9Q91Y11 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha9Q91Y11 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha9Q91Y11 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha9Q91Y11 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdha9Q91Y11 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms