Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ4

Pcdhb6, Protocadherin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb6Q91XZ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcdhb6Q91XZ4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcdhb6Q91XZ4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcdhb6Q91XZ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdhb6Q91XZ4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdhb6Q91XZ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb6Q91XZ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb6Q91XZ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb6Q91XZ4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdhb6Q91XZ4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms