Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ2

Pcdhb8, Protocadherin beta-8, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb8Q91XZ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb8Q91XZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb8Q91XZ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb8Q91XZ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb8Q91XZ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb8Q91XZ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb8Q91XZ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb8Q91XZ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb8Q91XZ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb8Q91XZ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb8Q91XZ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb8Q91XZ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdhb8Q91XZ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcdhb8Q91XZ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb8Q91XZ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb8Q91XZ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcdhb8Q91XZ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb8Q91XZ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb8Q91XZ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcdhb8Q91XZ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcdhb8Q91XZ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms