Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csde1Q91W50 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csde1Q91W50 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csde1Q91W50 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csde1Q91W50 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Csde1Q91W50 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Csde1Q91W50 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csde1Q91W50 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csde1Q91W50 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csde1Q91W50 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Csde1Q91W50 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csde1Q91W50 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms