Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Klc3Q91W40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Klc3Q91W40 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Klc3Q91W40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Klc3Q91W40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Klc3Q91W40 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Klc3Q91W40 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Klc3Q91W40 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Klc3Q91W40 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Klc3Q91W40 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Klc3Q91W40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Klc3Q91W40 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Klc3Q91W40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Klc3Q91W40 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Klc3Q91W40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Klc3Q91W40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms