Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsmce2Q91VT1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce2Q91VT1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsmce2Q91VT1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsmce2Q91VT1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce2Q91VT1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce2Q91VT1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce2Q91VT1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce2Q91VT1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce2Q91VT1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce2Q91VT1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms