Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI7

Ccdc65, Coiled-coil domain-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc65Q8VHI7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc65Q8VHI7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc65Q8VHI7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc65Q8VHI7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc65Q8VHI7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc65Q8VHI7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc65Q8VHI7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms