Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36,44■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36,42■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,4■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Cul7Q8VE73 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36,38■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36,38■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36,35■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36,34■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,34■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36,33■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Cul7Q8VE73 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36,27■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36,26■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Cul7Q8VE73 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC36,22■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36,22■■■■□ 3,39
Cul7Q8VE73 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36,18■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,14■■■■□ 3,38
Cul7Q8VE73 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC36,1■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Cul7Q8VE73 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36,04■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Cul7Q8VE73 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Cul7Q8VE73 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Cul7Q8VE73 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Cul7Q8VE73 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Cul7Q8VE73 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Cul7Q8VE73 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35,98■■■■□ 3,35
Cul7Q8VE73 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Cul7Q8VE73 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Cul7Q8VE73 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms