Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29,32■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,31■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
SnrkQ8VDU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,26■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,26■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29,25■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29,24■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
SnrkQ8VDU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29,16■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
SnrkQ8VDU5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
SnrkQ8VDU5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29,07■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29,07■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29,04■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29,04■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
SnrkQ8VDU5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms