Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rprd1aQ8VDS4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rprd1aQ8VDS4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rprd1aQ8VDS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rprd1aQ8VDS4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rprd1aQ8VDS4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms