Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ClmpQ8R373 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ClmpQ8R373 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ClmpQ8R373 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClmpQ8R373 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ClmpQ8R373 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClmpQ8R373 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms