Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D1

Vmn1r22, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r22Q8R2D1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r22Q8R2D1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r22Q8R2D1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r22Q8R2D1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r22Q8R2D1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r22Q8R2D1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vmn1r22Q8R2D1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r22Q8R2D1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r22Q8R2D1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r22Q8R2D1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r22Q8R2D1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms