Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpv3Q8K424 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpv3Q8K424 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpv3Q8K424 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpv3Q8K424 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpv3Q8K424 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpv3Q8K424 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpv3Q8K424 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpv3Q8K424 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms