Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z8

Ube2q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q2Q8K2Z8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube2q2Q8K2Z8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube2q2Q8K2Z8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube2q2Q8K2Z8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ube2q2Q8K2Z8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ube2q2Q8K2Z8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms