Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prpf39Q8K2Z2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf39Q8K2Z2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf39Q8K2Z2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf39Q8K2Z2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf39Q8K2Z2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms