Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd3Q8K2F0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd3Q8K2F0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Brd3Q8K2F0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brd3Q8K2F0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brd3Q8K2F0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd3Q8K2F0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms