Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scara5Q8K299 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scara5Q8K299 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scara5Q8K299 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scara5Q8K299 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms