Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c1Q8K284 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c1Q8K284 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c1Q8K284 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c1Q8K284 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c1Q8K284 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c1Q8K284 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms