Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gin1Q8K259 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gin1Q8K259 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gin1Q8K259 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gin1Q8K259 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms