Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nek9Q8K1R7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek9Q8K1R7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nek9Q8K1R7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nek9Q8K1R7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek9Q8K1R7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms