Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem17Q8K0U3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem17Q8K0U3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem17Q8K0U3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem17Q8K0U3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms