Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc47a1Q8K0H1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc47a1Q8K0H1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc47a1Q8K0H1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms