Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf628Q8CJ78 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf628Q8CJ78 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf628Q8CJ78 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf628Q8CJ78 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf628Q8CJ78 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf628Q8CJ78 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf628Q8CJ78 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Znf628Q8CJ78 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf628Q8CJ78 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf628Q8CJ78 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Znf628Q8CJ78 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms