Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIL4

Uncharacterized protein C1orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CIL4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CIL4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CIL4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CIL4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q8CIL4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CIL4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CIL4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CIL4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CIL4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q8CIL4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CIL4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CIL4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CIL4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CIL4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CIL4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q8CIL4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q8CIL4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms