Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI52

Gramd1c, GRAM domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1cQ8CI52 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gramd1cQ8CI52 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gramd1cQ8CI52 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gramd1cQ8CI52 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gramd1cQ8CI52 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd1cQ8CI52 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gramd1cQ8CI52 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms