Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nup88Q8CEC0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup88Q8CEC0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup88Q8CEC0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nup88Q8CEC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nup88Q8CEC0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nup88Q8CEC0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms