Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttc27Q8CD92 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttc27Q8CD92 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttc27Q8CD92 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttc27Q8CD92 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttc27Q8CD92 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.4 ms