Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ephb1Q8CBF3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ephb1Q8CBF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ephb1Q8CBF3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ephb1Q8CBF3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ephb1Q8CBF3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb1Q8CBF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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