Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbxo48Q8CAT8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fbxo48Q8CAT8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo48Q8CAT8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo48Q8CAT8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo48Q8CAT8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo48Q8CAT8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo48Q8CAT8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo48Q8CAT8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo48Q8CAT8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo48Q8CAT8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms