Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac7Q8C2B3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac7Q8C2B3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac7Q8C2B3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac7Q8C2B3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac7Q8C2B3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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