Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rsph4aQ8BYM7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rsph4aQ8BYM7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsph4aQ8BYM7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rsph4aQ8BYM7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rsph4aQ8BYM7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Rsph4aQ8BYM7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rsph4aQ8BYM7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rsph4aQ8BYM7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsph4aQ8BYM7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rsph4aQ8BYM7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms