Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ythdf3Q8BYK6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdf3Q8BYK6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ythdf3Q8BYK6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdf3Q8BYK6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdf3Q8BYK6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms