Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdh12Q8BYK4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdh12Q8BYK4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdh12Q8BYK4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh12Q8BYK4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rdh12Q8BYK4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh12Q8BYK4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh12Q8BYK4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms